Exiqon opererer i to forretningsområder: Life Sciences og Diagnostics. Exiqon Life Sciences udvikler og sælger produkter til analyse af genaktivitet, som forskere verden over i forskningsinstitutioner, biotek- og medicinalindustrien bruger til at gøre banebrydende opdagelser om sammenhænge mellem geners aktivitet i cellerne og udviklingen af kræft og andre sygdomme. Exiqon udfører også analyser på vegne af selskabets kunder som en serviceydelse. 

Exiqon Diagnostics er førende leverandør af teknologier til måling af næste generations biomarkører. Desuden udnytter selskabet sin indsigt i genaktivitet og biomarkører til at udvikle en række moderne diagnostiske produkter, der imødekommer et stort, udækket behov for bedre diagnostik og valg af behandling. Produkterne planlægges markedsført gennem partnerskaber.

Inden for blot 10-20 år kan behandlingen af patienter på Danmarks sygehuse være revolutioneret. Bedre biologisk forståelse har skabt en trend mod skræddersyet medicin, der vil gøre det muligt for læger at diagnosticere sygdomme som f.eks. kræft meget tidligt og vælge den medicin, der passer til den enkelte patients biologiske profil. Det er den vision, Exiqon arbejder for at realisere.

Skræddersyet medicin bygger især på ny viden om de små molekyler kaldet microRNA (miRNA), som regulerer cellernes funktion og sundhed. MiRNA har stort potentiale som biomarkører, fordi de kan give vigtig information om sygdomme og hjælp til f.eks. at stille tidlige og præcise diagnoser eller til at forudsige, hvordan en sygdom vil udvikle sig, og hvordan en patient vil reagere på behandlingen.